这篇文章的主要内容是在澳大利亚的四个污水处理厂中进行采样,运用18SrRNA作为NGS的靶标,并采用哺乳动物阻断引物减少哺乳动物DNA的扩增,同时通过对比检测生物信息学分析等方法检测真核生物,分析人类肠道寄生虫。
污水厂地点和不同处理阶段的采样
1-4号污水处理厂的不同处理阶段(进水,中间和出水)的隐孢子虫的18S-NGS序列百分比组成图。其实验获得的原始成对的末端序列总数上,真核生物的18S大约为万,隐孢子虫大致为30.5万,预处理并去除潜在的污染物以及其他非特异性类群后分别降至万和2万,并同时对4个污水厂各自的相关数据进行分析。
此研究表明了以V9区为靶点的真核18S-NGS方法对检测废水中可能低丰度的肠道寄生虫的灵敏度不足。其所采取的特异性的隐孢子虫18S-NGS方法成功对4个污水厂污水的肠道寄生虫病原菌进行了检测。同时此研究的方法也对很多其他场景的运行中的微生物的鉴定具有一定的效果。
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